Parte fundamental da história, os elementos são naturezas de chakra que podem ser utilizados em Jutsus. Em Naruto, os 5 principais elementos são: Katon (Fogo), Suiton (Água), Doton (Terra), Fuuton (Vento) e Raiton (Raio). Cada um deles tem uma fraqueza e também uma vantagem, formando assim um ciclo:
Esses são elementos simples, ou elementos da natureza, que você já nasce dominando um deles.
O Elemento Fogo é recorrente entre usuários do clã Uchiha, de Konoha. O fogo é alimentado pelo vento, ao mesmo tempo que é suprimido pela água. Na série foram mostradas diversas técnicas do elemento fogo, seus principais usuários são Uchiha Itachi, Uchiha Sasuke, Sarutobi Hiruzen, Jiraya, Sarutobi Asuma, Kakuzu e eventualmente Kakashi. Os Bijuus Yonbi e Nibi também são capazes de utilizar técnicas de fogo.
O Elemento Água é mais comum entre os membros das Vilas Ocultas da Névoa, muito embora seja utilizado por diversos ninjas da série. A água leva vantagem sobre o fogo, porém é fraca contra a terra. Muitas técnicas do elemento Água já foram mostradas, seus principais usuários são Hoshigaki Kisame, Tobirama Senjuu, Zabuza, Yamato, Darui e eventualmente Hatake Kakashi, entre outros. Os Bijuus Sanbi e Rokubi também são usuários de ténicas de água.
O Elemento Terra é característico dos membros da Vila Oculta da Pedra, mas também é usado por muitos outros ninjas. A terra é derrotada pelo raio, mas tem vantagem contra a água. São diversas as técnicas de Terra que já apareceram, os usuários mais frequentes são Orochimaru, Sarutobi Hiruzen, Jiroubou, Akatsuchi, Kakashi, Yamato e Kakuzu, entre muitos outros. O Bijuu Yonbi também é capaz de manipular a Terra.
O Elemento Vento é o mais raro dos 5 Elementos principais, de acordo com Kakashi são poucos os shinobis em Konoha que são capazes de manipular essa natureza. O vento tem vantagem sobre o raio e fraqueza sobre o fogo, seus principais usuários na série são Danzou, Temari, Naruto e Kakuzu, esse é o único dos 5 elementos principais que Kakashi nunca usou. Os Bijuus Ichibi e Shichibi são capazes de manipular o Vento.
O Elemento Raio é extremamente poderoso e também um tanto incomum. Ele tem vantagem contra a terra mas é fraco contra o vento. Os usuários de Raiton são geralmente vinculados à Vila Oculta da Nuvem, mas até agora apenas dois deles de fato são de lá. Os personagens mais famosos que usam Raiton são Kakashi, Sasuke, Raikage, Kakuzu e Darui, entre outros, como membros da ANBU.
Elementos Secundários:
Além dos 5 elementos principais, Naruto apresenta diversos elementos secundários que completam a gama de técnicas e são geralmente possíveis graças a heranças genéticas (kekkei genkais), que misturam elementos. Geralmente os ninjas que possuem um elemento secundário são únicos e extremamente poderosos. Muitos desses elementos são essenciais para a trama, tal como o Mokuton, outros são apenas existentes em fillers, como o Shouton. Abaixo, um pouco mais sobre cada um deles:
Além dos 5 elementos principais, Naruto apresenta diversos elementos secundários que completam a gama de técnicas e são geralmente possíveis graças a heranças genéticas (kekkei genkais), que misturam elementos. Geralmente os ninjas que possuem um elemento secundário são únicos e extremamente poderosos. Muitos desses elementos são essenciais para a trama, tal como o Mokuton, outros são apenas existentes em fillers, como o Shouton. Abaixo, um pouco mais sobre cada um deles:
O Hyouton, ou simplesmente Elemento Gelo, tem sua primeira aparição quando usado por Haku, o parceiro de Zabuza. Graças a sua Kekkei Genkai, Haku é capaz de combinar os elementos Água e Vento afim de criar o Gelo, um elemento que não derrete com ataques de fogo. Outro detalhe interessante que a kekkei genkai de Haku lhe proporciona é a capacidade de realizar jutsus com apenas uma mão. Haku é capaz de criar Hyouton sem a necessidade de elementos externos, já no 1 filme de Naruto são mostrados usuários do Elemento Gelo que conseguem manipular o gelo ao seu redor, mas não criá-lo, e, portanto não possuem kekkei genkai (isso é confirmado quando Kakashi copia um dos seus jutsus).
O Mokuton, ou Elemento Madeira, é o elemento secundário mais decorrente e famoso no anime, ele tem sua primeira aparição durante a invasão da Konoha, quando Orochimaru usa o Edo Tensei para trazer à vida o Primeiro e o Segundo Hokage. Muito embora seu uso tenha sido exclusivo do Shodaime Hokage, Hashirama, na saga atual alguns personagens se revelam capazes de utilizá-lo, todos eles por possuírem células de Hashirama. São eles, Yamato, o jounin da Folha que costumava servir a ANBU e é resultado de uma experiência de Orochimaru, Danzou, o chefe da ANBU raiz que revela ter feito experiências com Orochimaru no seu próprio corpo e Zetsu, uma criação de Tobi que também foi baseada nas células do Shodaime. Desses citados apenas Yamato parece controlar o Mokuton com perfeição, além de manipular também a água e a terra muito bem.
O Youton, Elemento Lava, é um elemento que foi recentemente mostrado como resultado da mistura de Fogo e Terra, através de uma das kekkei genkais de Mei Terumi, a atual Mizukage. Muito embora ela tenha usado-o somente uma vez na batalha contra Sasuke, seu poder mostrou-se muito eficaz. De acordo com a série, o Jinchuuriki do Yonbi também é capaz de usar Youton.
Jinton, ou apenas Elemento Poeira, é um elemento recém mostrado na história e com um poder destrutivo assustador. Seus únicos usuários apresentados são Onoki e seu mestre, mas não ficou claro se o elemento é produto de uma kekkei genkai ou se é apenas uma técnica variada. Através da manipulação do Jinton, Onoki é capaz de materializar formas geométicas e expandi-las, englobando objetos, pessoas ou qualquer outra coisa e desmaterializando-os em seguida com uma espécie de implosão.
O Ranton, também chamado Elemento Tempestade, é uma fusão dos elementos Água e Raio e criada pela kekkei genkai do seu único usuário mostrado na série até agora, Darui, um jounin extremamente habilidoso da Vila Oculta da Nuvem que faz parte da guarda pessoal do Raikage. Seu jutsu de Ranton, Lazer Circus, ainda tem força desconhecida, já que no seu único uso foi barrado pelo Susano de Sasuke, porém aparenta ser um elemento muito poderoso.
O Futton, tido como Elemento Ácido, é a segunda manipulação elemental concedida pela kekkei genkai de Mei Terumi. Não se sabe muito sobre esse elemento, mas em seu único uso mostrado ele foi capaz de derreter a defesa absoluta do Mankegyou Sharingan, o Susaano.
O Kouton, elemento Aço, é fruto de uma das kekkei genkais roubadas por Hiruko, o antagonista do terceiro filme de Naruto Shippuuden, Os Herdeiros da Vontade de Fogo. Pouco se sabe sobre esse elemento, a não ser que seus jutsus são muito eficientes para defesa.
O Shouton, Elemento Cristal, é um elemento secundário fruto da kekkei genkai de Guren, uma personagem da saga filler de Naruto Shippuuden. O Shouton é um dos elementos mais poderosos já mostrados na série, capaz de cristalizar qualquer sólido, incluindo outros elementos como Suiton e Doton. Guren consegue criar Shouton a partir de qualquer coisa, e, portanto, pode usar até mesmo o ar como arma. Vários jutsus com o Shouton são mostrados durante o filler.
O Enton, Elemento Chama, é um elemento que foi revelado recentemente por Uchiha Sasuke. Ele consiste na verdade da manipulação da técnica do Mangekyou Sharingan, Amateratsu, para outros fins, como proteção por exemplo. Pouco foi mostrado acerca do Enton até agora.
O Jiton é o Elemento Magnetismo. Sua primeira aparição na história se da na luta com Sasori, através da marionete do Sandaime Kazekage. Outros usuários conhecidos do Jiton são o Yondaime Kazekage, pai de Gaara, e um ninja recém mostrado na guerra, no manga. Esse elemento permite diversos jutsus com diferentes efeitos e é muito dinâmico e poderoso.
O Meiton, literalmente Elemento Escuridão, é um elemento fruto de uma das Kekkei Genkais roubadas por Hiruko, o antagonista do terceiro filme de Naruto Shippuuden, Os Herdeiros da Vontade de Fogo. Pouco se sabe sobre esse elemento.